患部のイボの外科的切除、液体窒素による凍結療法、炭酸ガスレーザーによる蒸散などが行われますが、外用療法としては５FU軟膏、ブレオマイシン軟膏、イミキモドクリームなどがあります。
またインターフェロンといった薬物による治療も行われます。

この病気はパートナーも同時に感染しているケースがありますので、必ずパートナーも検査を受けましょう。